Soru:
Bir hücrede protein sentezi sırasında ribozom, mRNA üzerinde 5'-...AAU CGA GGC...-3' dizilimini okumaktadır.
Bu sırada ribozomun A (Aminoasil), P (Peptidil) ve E (Çıkış) bölgelerinde bulunan tRNA'ların taşıdığı amino asitler sırasıyla "Treonin (Thr)", "Arjinin (Arg)" ve "Glisin (Gly)" dir.
Buna göre, bir peptidil transferaz reaksiyonu tamamlandıktan sonra (translokasyon öncesi) bu üç bölgede bulunan tRNA'ların taşıdığı amino asitler ve bağlı oldukları mRNA kodonları nelerdir?
Çözüm:
💡 Ribozomun işleyişi: Yeni gelen tRNA A bölgesine, peptidil tRNA P bölgesine, boş tRNA ise E bölgesine bağlanır. Peptidil transferaz, P'deki zinciri A'ya ekler.
- ➡️ 1. Adım: Mevcut Durumu Anlama:
mRNA: ... AAU (P) - CGA (A) - GGC (E) ...
P bölgesi (Arg taşıyan tRNA) → CGA kodonu.
A bölgesi (Thr taşıyan tRNA) → GGC kodonu? HAYIR! Bu mantıksız. A bölgesi, okunan bir sonraki kodon olan GGC'ye bağlanır ve Gly taşır. Verilen "Thr" bilgisi hatalı veya farklı bir an için geçerli olmalı. Doğru okuma:
P: CGA kodonu → Arg taşıyan tRNA
A: GGC kodonu → Gly taşıyan tRNA
E: AAU kodonu → Thr taşıyan (ama artık amino asitsiz) tRNA
- ➡️ 2. Adım: Peptidil Transferaz Reaksiyonu: P bölgesindeki polipeptit zinciri (Arg), A bölgesindeki amino aside (Gly) bağlanır. Zincir artık A bölgesindeki tRNA'ya bağlıdır.
Reaksiyon Sonrası:
P bölgesi tRNA'sı: Boş (amino asitsiz)
A bölgesi tRNA'sı: Arg - Gly zincirini taşır.
E bölgesi tRNA'sı: Boş (çıkmak üzere)
✅ Sonuç (Translokasyon Öncesi): P: Boş tRNA (CGA) | A: Arg-Gly zinciri (GGC) | E: Boş tRNA (AAU)
