Soru: Riboz ve deoksiribozun yapısal formüllerini düşünün. Her iki şekerde de karbon atomları numaralandırılmıştır (1'den 5'e). Hangi karbon atomları arasında fosfodiester bağları oluşarak nükleik asit zincirleri meydana gelir?
Çözüm: Riboz ve deoksiribozda, nükleik asit zincirleri oluşurken fosfodiester bağları belirli karbon atomları arasında kurulur. Adım adım açıklayalım:
- Her nükleotid, bir şeker (riboz veya deoksiriboz), bir fosfat grubu ve bir azotlu bazdan oluşur.
- Fosfodiester bağları, bir nükleotidin şekerinin 3. karbon atomu (3' karbonu) ile bir sonraki nükleotidin şekerinin 5. karbon atomu (5' karbonu) arasında fosfat grupları aracılığıyla oluşur.
- Bu, nükleik asit zincirinin iskeletini meydana getirir: şeker-fosfat omurgası.
- Örneğin, DNA'da deoksiriboz şekerlerinin 3' ve 5' karbonları arasında fosfodiester bağları vardır; RNA'da ise riboz şekerlerinin 3' ve 5' karbonları arasında benzer bağlar bulunur.
Sonuç olarak, fosfodiester bağları her iki şekerde de 3. ve 5. karbon atomları arasında oluşur, bu da nükleik asitlerin lineer yapısını sağlar.