Cumhurbaşkanına tanınan teşkilat düzenleme yetkisi, özellikle 2017 Anayasa değişikliği sonrasında önemli bir tartışma konusu haline gelmiştir. Bu yetki, Cumhurbaşkanının doğrudan kararname çıkarma yoluyla kamu kurum ve kuruluşlarının yapısını, görevlerini ve işleyişini düzenleyebilmesini ifade eder. Ancak bu yetkinin sınırları ve kapsamı, Anayasa Mahkemesi'nin (AYM) çeşitli kararlarıyla şekillenmiştir.
2017 Anayasa değişikliği ile 104. maddeye eklenen hükümle Cumhurbaşkanına, kanunla düzenlenen konularda Cumhurbaşkanlığı kararnamesi (CBK) çıkarma yetkisi verilmiştir. Ancak bu yetki sınırsız değildir. Anayasa'nın 104. maddesi, CBK ile düzenlenemeyecek alanları açıkça belirtmektedir. Bunlar arasında temel haklar, kişi hakları ve ödevleri ile siyasi haklar ve ödevler yer alır. Ayrıca, kanunda açıkça düzenlenen konularda da CBK çıkarılamaz.
AYM, CBK'ların anayasaya uygunluğunu denetleme yetkisine sahiptir. Bu kapsamda verdiği kararlar, Cumhurbaşkanının teşkilat düzenleme yetkisinin sınırlarını belirlemede kritik bir rol oynar. AYM, kararlarında özellikle şu hususlara dikkat etmektedir:
Cumhurbaşkanının teşkilat düzenleme yetkisine ilişkin AYM'nin birçok kararı bulunmaktadır. Bu kararlardan bazıları şunlardır:
Cumhurbaşkanının teşkilat düzenleme yetkisi, kamu yönetiminin etkinliği ve hızlı karar alma süreçleri açısından önemli bir araçtır. Ancak bu yetkinin, Anayasa'nın çizdiği sınırlar içinde kullanılması ve AYM'nin denetimine tabi olması gerekmektedir. Aksi takdirde, kuvvetler ayrılığı ilkesi zedelenebilir ve temel hak ve özgürlükler ihlal edilebilir.