Hücrenin enerji üretim merkezi olan mitokondri, canlılığın devamı için gerekli olan ATP'nin büyük kısmını üretir. Bu sürecin kalbinde ise Krebs döngüsü (Sitrik Asit Döngüsü veya TCA döngüsü) yer alır. Peki bu hayati biyokimyasal döngü tam olarak nerede gerçekleşir? Cevap: Mitokondrinin matriks bölgesinde.
Mitokondri, çift zarla çevrili bir organeldir. Krebs döngüsü, bu zarların iç kısmında bulunan sıvı-benzeri dolgu alanı olan matrikste meydana gelir. Matriks, döngüde görev alan tüm enzimlerin, koenzimlerin ve substratların bir arada bulunması için ideal bir ortamdır.
Bu döngünün matrikste olması stratejik bir avantaj sağlar:
Bir tur Krebs döngüsünde (1 asetil-CoA için) matrikste şunlar üretilir:
Buradaki NADH ve FADH₂, matriksten iç zarın zar proteinlerine (ETZ) aktarılarak oksidatif fosforilasyon ile büyük miktarda ATP üretimini başlatır. Yani Krebs döngüsü, enerji üretiminin "para çekme fişi" olan bu taşıyıcıları matrikste hazırlar.
Krebs döngüsünün mitokondri matriksinde gerçekleştiğini bilmek, hücresel solunumun mekansal organizasyonunu anlamak açısından kritiktir. Bu organizasyon olmasaydı, enerji üretimi bu kadar verimli olamazdı. Matriks, sadece bir "sıvı alan" değil, hayati biyokimyasal reaksiyonlar için özelleşmiş, korunaklı ve son derece verimli bir biyokimyasal reaktördür.
Dolayısıyla, "Krebs döngüsü nerede olur?" sorusunun cevabı, hücrenin enerji ekonomisinin temel taşını anlamak için ilk adımdır: Mitokondrinin kalbi olan matrikste.