Doğada gördüğümüz her şey, atomların bir araya gelerek oluşturduğu moleküllerden meydana gelir. Bu moleküllerin birbirleriyle ve diğer maddelerle nasıl etkileşime girdiği, onların polar veya apolar özelliklerine bağlıdır. Bu özellikler, maddelerin çözünürlüğünden kaynama noktasına kadar pek çok fiziksel ve kimyasal özelliğini etkiler.
Polar moleküller, atomlar arasındaki elektronegatiflik farkından kaynaklanan kısmi yüklere sahip moleküllerdir. Elektronegatiflik, bir atomun bağ elektronlarını kendine çekme yeteneğinin bir ölçüsüdür. Eğer bir molekülde elektronegatifliği yüksek bir atom varsa, bu atom bağ elektronlarını daha çok kendine çekecek ve kısmi negatif yük (δ-) ile yüklenirken, diğer atomlar kısmi pozitif yük (δ+) ile yüklenecektir.
Apolar moleküller, atomlar arasındaki elektronegatiflik farkının çok az olduğu veya molekül geometrisinin yük dağılımını dengelediği moleküllerdir. Bu moleküllerde, elektronlar atomlar arasında eşit veya neredeyse eşit bir şekilde paylaşılır, bu da molekülün genel olarak yüksüz olmasına neden olur.
"Benzer benzeri çözer" ilkesi, polar maddelerin polar çözücülerde, apolar maddelerin ise apolar çözücülerde daha iyi çözündüğünü ifade eder. Bunun nedeni, benzer polariteye sahip moleküller arasındaki çekim kuvvetlerinin, farklı polariteye sahip moleküller arasındaki çekim kuvvetlerinden daha güçlü olmasıdır.
Moleküllerin polar veya apolar olması, sadece çözünürlüklerini değil, aynı zamanda kaynama noktalarını, yüzey gerilimlerini ve diğer moleküllerle olan etkileşimlerini de etkiler. Bu özellikler, biyolojik sistemlerden endüstriyel işlemlere kadar pek çok alanda önemlidir.