Görev uyuşmazlığı, adli, idari ve askeri yargı mercilerinden hangisinin bir uyuşmazlığı çözmekle görevli olduğu konusunda ortaya çıkan anlaşmazlıktır. Bu uyuşmazlık, farklı yargı mercilerinin kendilerini görevli veya görevsiz görmesiyle meydana gelebilir. Görev uyuşmazlıkları, yargı sisteminin etkin ve hızlı işlemesini engelleyebileceği için çözümü büyük önem taşır.
Türkiye'de görev uyuşmazlıklarının çözümü, Uyuşmazlık Mahkemesi'nin yetkisindedir. Ancak yüksek mahkemeler arasındaki bazı özel durumlarda, görev uyuşmazlıklarının çözümü farklılık gösterebilir.
Anayasa Mahkemesi'nin bireysel başvuru incelemesi yaparken diğer yüksek mahkemelerin kararlarıyla ilgili görev uyuşmazlıkları yaşanabilir. Bu tür durumlarda Uyuşmazlık Mahkemesi'nin kararları belirleyici olur.
Yargıtay ve Danıştay arasındaki görev uyuşmazlıkları, özellikle karmaşık hukuki konularda sıklıkla karşılaşılan bir durumdur. Bu iki yüksek mahkeme arasındaki uyuşmazlıklar, genellikle idari yargı ve adli yargı arasındaki sınırların belirsizliğinden kaynaklanır.
AYİM'in kaldırılmasıyla birlikte, askeri yargı alanına giren uyuşmazlıkların çözümü de değişmiştir. AYİM'in görev alanına giren davalar artık Danıştay'da görülmektedir. Bu durum, görev uyuşmazlıklarının çözümünde yeni bir dönemi başlatmıştır.
Görev uyuşmazlığı, yargı sisteminin sağlıklı işlemesi için çözülmesi gereken önemli bir sorundur. Yüksek mahkemeler arasındaki görev uyuşmazlıklarının çözümü, hukukun üstünlüğü ilkesinin ve yargı bağımsızlığının korunması açısından büyük önem taşır.