Soru:
DNA ligaz enzimi, \(ATP\) veya \(NAD^+\) gibi bir ko-faktöre ihtiyaç duyar. Bu ko-faktörün temel işlevi nedir?
- A) DNA zincirini denatüre etmek
- B) Enzime bağlanarak onun aktif şeklini almasını sağlamak
- C) Fosfodiester bağının oluşumu için gerekli enerjiyi sağlamak üzere kullanılmak
- D) Reaksiyon sonunda hidrolize olarak enerji açığa çıkarmak
Çözüm:
⚡️ DNA ligaz, iki nükleotid arasında kovalent bir bağ (fosfodiester bağı) oluşturduğu için enerji gerektiren bir reaksiyonu katalizler.
- ➡️ DNA ligaz enzimi, önce \(ATP\) (ökaryot ve virüslerde) veya \(NAD^+\) (bakterilerde) ile reaksiyona girerek bir ara ürün oluşturur.
- ➡️ Bu süreçte, ko-faktörden gelen AMP (Adenozin Monofosfat) grubu, enzimin bir lizin kalıntısına bağlanır ve enzimi aktive eder.
- ➡️ Daha sonra bu AMP grubu, DNA'daki 5'-fosfat grubuna aktarılır, bu da fosfatı yüksek enerjili bir hale getirir.
- ➡️ Son olarak, komşu nükleotidin 3'-OH grubu, bu yüksek enerjili fosfata saldırarak fosfodiester bağını oluşturur ve AMP serbest kalır.
- ➡️ Bu mekanizma, ko-faktörün enerji kaynağı olarak kullanıldığını gösterir. A seçeneği yanlıştır. B seçeneği kısmen doğru olmakla birlikte, asıl vurgu enerji sağlamaktır. D seçeneği ise süreci tam olarak tanımlamaz.
✅ Doğru cevap, ko-faktörün bağ oluşumu için gerekli enerjiyi sağladığını belirten C seçeneğidir.
