Bağlı genler, aynı kromozom üzerinde bulunan ve birlikte kalıtılma eğilimi gösteren genlerdir. Bu genler, kromozom üzerinde birbirlerine yakın konumda bulundukları için mayoz bölünme sırasında crossing over (parça değişimi) olayı gerçekleşmediği sürece birlikte hareket ederler.
Bağlı genlerin ayrılması, temel olarak crossing over (parça değişimi) olayı ile gerçekleşir. Crossing over, homolog kromozomlar arasındaki genetik materyal alışverişidir. Bu olay sırasında, bağlı genler farklı kromozomlara geçebilir ve böylece ayrılabilirler.
Crossing over, bağlı genlerin arasındaki mesafeye bağlı olarak farklı sıklıkta gerçekleşir. Genler arasındaki mesafe ne kadar uzaksa, crossing over olasılığı da o kadar yüksektir. Bu durum, genetik haritaların oluşturulmasında önemli bir rol oynar.
Rekombinasyon frekansı (RF), aşağıdaki formülle ifade edilebilir:
$RF = \frac{Rekombinant\,Birey\,Sayısı}{Toplam\,Birey\,Sayısı} \times 100$
Örneğin, bir deneyde toplam 200 birey incelenmiş ve 30 tanesi rekombinant bulunmuştur. Bu durumda rekombinasyon frekansı:
$RF = \frac{30}{200} \times 100 = %15$
Bu, incelenen genler arasındaki mesafenin yaklaşık olarak 15 cM olduğunu gösterir.